فصل اول و دوم
خنده ۲۵ ثانیهای: در شروع برنامه رامبد جوان، حضار و بینندگان را به خندیدن به مدت ۲۵ ثانیه دعوت میکند
بستن کمربند: به صورت نمادین در اول برنامه
خواندن آهنگ برنامه: توسط حضار آهنگهای نظیر «خلیج فارس» و «ایران ایران»
گزارشگر سطح شهر تهران: مصاحبه با صاحبان مشاغل و کارآفرینان و هنرمندان
گزارشگر استانی: همراه با بهروز بقایی
پخش گزارش از کارهای خیریه: توسط «هنرمندان» و تیم «خندوانه» در سطح کشور
مهمان برنامه: شامل گپ و گفت و مسابقه دارت و پرتاب حلقه و خنده ۵ ثانیهای و اهدای لوح تقدیر…
اجرای نمایش طنز: توسط بازیگران خندوانه شامل «جناب خان» و «نیما شعباننژاد» و «دانیال غفارزاده» با رامبد جوان و حضار
ایستاده با طنز: استندآپ کمدی توسط کمدینهای برنامه
مسابقه خنداننده برتر: بین ۱۶ کمدین (فصل دوم خندوانه)
مسابقه داخل استودیو: ویژه حضار
مسابقه پیامکی: ویژه بینندگان
قرعه کشی: ویژه بینندگان
اهدای تندیس بهترین لبخند: در پایان هر هفته انتخابی از سوی بینندگان
باز کردن کمربند: به صورت نمادین در آخر برنامه
خداحافظی: با جمله معروف «شاد باشید»
در فصل دوم، خندوانه هر شب ۱۰۰ تماشاچی[۱۶] را از کسانی که با خندوانه تماس گرفته بودند را بهصورت رایگان در خود جای میداد.[۱۷]
خندوانه در فصل دوم به دلیل حضور جناب خان و مسابقه خنداننده برتر بسیار معروفتر و محبوبتر شد